Die Trübung von Gewässern wird meist durch aufgewirbelte oder eingeschwemmte Partikel bestimmt. Allerdings kann diese auch durch im Wasser lebende Algen hervorgerufen werden. Algen enthalten den Farbstoff Chlorophyll-a, mit dessen Hilfe sie Photosynthese betreiben. Die Bestimmung der Chlorophyll-a Konzentration kann als Maß für die Algenmenge im Gewässer dienen. Je mehr Algen vorhanden sind, desto höher ist die Chlorophyll-a Konzentration. Blaualgen (BGA), auch bekannt als Cyanobakterien, können weitere Pigmente enthalten, wie z.B. Phycocyanin oder Phycoerythrin.

Blaualgen können dabei vielseitige Einflüsse auf die Gewässerbeschaffenheit haben. Einerseits können sie Stickstoff und Kohlenstoff im Wasser reduzieren, bei Überschuss jedoch auch den gelösten Sauerstoff abbauen, und können so eine ernsthafte Bedrohung für die Wasserqualität, die Stabilität des Ökosystems und die Trinkwasserversorgung darstellen. Andererseits können vor allem einige Blaualgen Giftstoffe bilden, die bei Hautkontakt oder Verschlucken Gesundheitsbeschwerden hervorrufen können. Daher ist die Überwachung von Blaualgen in Trinkwasser-Reservoiren oder Badegewässern äußerst wichtig.

Die Xylem Marke YSI misst Blaualgen in Echtzeit mithilfe der In-vivo-Fluorometrie-Technik. Diese Methode erkennt direkt die Fluoreszenz eines bestimmten Pigments in lebenden Algenzellen und bestimmt die relative Algenbiomasse. Der Gesamtalgensensor von YSI ist ein Zweikanalsensor, der immer Chlorophyll-a und eines der Blaualgen-Pigmente (Phycocyanin oder Phycoerythrin) misst. Der Blaualgen-Sensor wird nicht durch Chlorophyll oder Trübung gestört.

Mit Hilfe der YSI-Multiparameter-Sonden ist es möglich, Algen kontinuierlich im Gewässer zu überwachen, sei es bei Spotmessungen mit der ProDSS oder in Langzeitanwendungen mit der EXO-Serie – auch integriert in komplexen Messsystemen wie Umweltmessbojen oder vertikalen Profilern. Die Photometer der WTW Photolab-Serie bieten die Möglichkeit der Chlorophyll-a Messung im Labor.